Την έντονη αντίδρασή της σχετικά με την απόφαση του Συμβουλίου της Επικρατείας σχετικά με το φόρο εισοδήματος για συγκεκριμένη κατηγορία ακινήτων εξέφρασε η Διαρκής Ιερά Σύνοδος, τονίζοντας ότι η πολιτεία δεν έχει τηρήσει τις δεσμεύσεις της.
Ειδικότερα, κατά τη συνεδρία της 6ης Σεπτεμβρίου η ΔΙΣ διευκρινίζει ότι οι αποφάσεις του ΣτΕ αφορούν σε φόρους εισοδήματος για μία ειδική κατηγορία ακινήτων, τους οποίους έχει ήδη εξοφλήσει η Εκκλησία της Ελλάδος (ως κεντρικό νομικό πρόσωπο με έδρα την Αθήνα).
“Ειδικότερα, το 1952 η Εκκλησία παραχώρησε στην Πολιτεία τεράστιες εκτάσεις αγροτολιβαδικής περιουσίας των Ιερών Μονών (770.000 στρέμματα) προς αποκατάσταση των πληγέντων από την Κατοχή και τον Εμφύλιο.
Εν όψει της μεγίστης εθνικής ανάγκης η Εκκλησία τότε δέχθηκε να μην αποζημιωθεί πλήρως από το Κράτος, αλλά να λάβει μειωμένο αντάλλαγμα, σε γη και χρήμα, ίσο με το 1/3 της αξίας της παραχωρουμένης περιουσίας της.
Η Πολιτεία παραχώρησε στην Εκκλησία μερικά δημόσια ακίνητα ως μειωμένο αντάλλαγμα και, προς αντιστάθμισμα της ανισοβαρούς σύμβασης, δεσμεύθηκε με νόμο ότι τουλάχιστον τα έσοδα από τα ακίνητα αυτά δεν θα φορολογούνται. Αργότερα η Πολιτεία μετέβαλε γνώμη και κατήργησε την απαλλαγή.
Το ΣτΕ με τις πρόσφατες αποφάσεις του έκρινε ότι η υπαναχώρηση αυτή και η φορολόγηση δεν είναι αντισυνταγματική, τουλάχιστον από πλευράς φορολογικού δικαίου. Φυσικά η Εκκλησία της Ελλάδος συμμορφώθηκε και έχει ήδη καταβάλει τους προαναφερθέντες φόρους.
Παραμένει βεβαίως το ζήτημα ότι η Πολιτεία δεν τήρησε εκ των υστέρων τις υποχρεώσεις της σχετικά με την Σύμβαση του 1952 απέναντι στην Εκκλησία.
Όπως επίσης παραμένει το ερώτημα εάν η Πολιτεία τήρησε και τις υποχρεώσεις της απέναντι στον ελληνικό Λαό, επειδή μέχρι σήμερα δεν είναι γνωστό εάν και πόσα από τα μοναστηριακά ακίνητα που απέκτησε το Δημόσιο έφθασαν πράγματι στα χέρια των ακτημόνων Ελλήνων εκείνης της εποχής ή συνεχίζουν να παρακρατούνται από το Δημόσιο.
Πάντως οι πρόσφατες αποφάσεις επιβεβαιώνουν την από 19.7.2012 επιστολή του Μακαριωτάτου Αρχιεπισκόπου Αθηνών και πάσης Ελλάδος κ. Ιερωνύμου προς τα Κόμματα ότι η Εκκλησία υπόκειται κανονικά σε φόρους εισοδήματος, ενώ όλες οι φοροαπαλλαγές, που προβλέπονταν ειδικά για την Ορθόδοξη Εκκλησία, έχουν εδώ και χρόνια καταργηθεί.
Ακολούθως η Δ.Ι.Σ. αποφάσισε την σύγκληση από 21ης έως 23ης Σεπτεμβρίου 2018 του Γ’ Μοναστικού Συνεδρίου στην Ιερά Μονή Φανερωμένης Λευκάδος με θέμα: «Ο ορθόδοξος Μοναχισμός και σύγχρονες μορφές Μοναχικής Πολιτείας» και ενέκρινε την διοργάνωση Ημερίδος, στις 23 Οκτωβρίου 2018, κατόπιν Εισηγήσεως της Ειδικής Συνοδικής Επιτροπής Χριστιανικών Μνημείων, στο Διορθόδοξο Κέντρο της Μονής Πεντέλης, με θέμα: «Κίνδυνοι των Χριστιανικών Μνημείων στη σημερινή εποχή».