Ο ιερός ναός του Αγίου Νικολάου έχει σχεδιαστεί από τον Ισπανό αρχιτέκτονα Καλατράβα και βρίσκεται στην κορυφή του Πάρκου Ελευθερίας με θέα το μνημείο και το μουσείο της 11ης Σεπτεμβρίου.
Η αρχιτεκτονική του ναού δίνει ιδιαίτερη βάση στο λευκό μάρμαρο, το οποίο επιτρέπει στο φως να αναβλύζει από μέσα και έτσι να φωταγωγεί την εκκλησία από τον εσωτερικό της χώρο. Το φως που εκπέμπεται είναι λευκό, συμβολίζοντας τη νίκη της αγάπης ενάντια στο σκότος της μισαλλοδοξίας και του μίσους.
Η ανοικοδόμηση του ναού χρειάστηκε να υπερβεί μεγάλα οικονομικά και γραφειοκρατικά εμπόδια, τα οποία οδήγησαν σε καθυστερήσεις πολλών ετών. Για την ανέγερσή του χρειάστηκε να δαπανηθούν 85 εκατομμύρια δολάρια, τα οποία συγκεντρώθηκαν μέσω δωρεών. Πλέον, ο ναός έχει σχεδόν ολοκληρωθεί, και υπολογίζεται ότι θα είναι έτοιμος να υποδεχθεί τους προσκυνητές για τις λειτουργίες της ερχόμενης Μεγάλης Εβδομάδας.
Τόπος εθνικού προσκυνήματος για τις ΗΠΑ
Ο Άγιος Νικόλαος δεν θα είναι απλώς ένας ελληνορθόδοξος ναός, καθώς, λόγω της σημασίας που έχει η τοποθεσία στο Σημείο Μηδέν, θα λειτουργεί και ως τόπος εθνικού προσκυνήματος για τον αμερικανικό λαό. Ως το μοναδικό σύμβολο πίστης στο Παγκόσμιο Κέντρο Εμπορίου, ο ναός θα καλωσορίζει ανθρώπους όλων των θρησκειών και των δογμάτων για διαλογισμό και περισυλλογή.
Αναπόφευκτα η ιστορία της ανέγερσης του Αγίου Νικολάου, είναι και θα παραμείνει άρρηκτα συνδεδεμένη με την ιστορία και την τραγωδία που σημάδεψε το Παγκόσμιο Κέντρο Εμπορίου.
Η ανέγερσή του με αυτά τα χαρακτηριστικά, τον καθιστά τη δεύτερη εκκλησία μετά τον Εθνικό Καθεδρικό Ναό της Ουάσιγκτον, που θα λειτουργεί ως εθνικός ναός των ΗΠΑ. Ως εκ τούτου, η μη κερδοσκοπική οργάνωση «Φίλοι του Αγίου Νικολάου», εκτιμά ότι ο νέος ναός θα είναι ίσως η εκκλησία που θα έχει τους πιο πολλούς μη ορθόδοξους επισκέπτες στον κόσμο, και εμφανίζεται σίγουρη ότι θα είναι ο ναός με τους περισσότερους επισκέπτες στην Νέα Υόρκη.